Los archivos en los que se guardan las preferencias de Final Cut o de cualquier otro programa de la suite (Motion, Color, Sound Track Pro..) pueden corromperse, lo que da lugar a que Final Cut no funcione correctamente.

En muchos casos cuando nuestro programa falla basta con borrar las preferencias para que todo vuelva a funcionar. Si hemos borrado las preferencias, al abrir Final Cut tendremos que configurarlo nuevamente como si acabáramos de instalarlo. En esta web de Apple se explica como borrar las preferencias, sin embargo la mejor forma de hacerlo es con el software gratuito Preference Manager que además de permitirnos borrar todas las preferencias de la suite Final Cut Studio sin dejar rastro podremos también realizar copias de seguridad de nuestras preferencias para poder restaurarlas en caso de problemas.